通信工程甲级监理公司为了保护通信数据的机密性，会采取以下措施：

1. 使用加密协议：监理公司会推动在通信工程中使用加密协议，如SSL/TLS协议。通过加密通信，可以防止通信数据在传输过程中被窃听或篡改。

2. 强化身份认证：监理公司会推动设备和系统的强制身份认证机制的实施。这包括使用密码、密钥、双因素认证等方式，确保通信双方的身份可信，并防止未经授权者获取敏感数据。

3. 加密存储：监理公司会鼓励或要求通信工程中设备和系统对数据进行加密存储。即使数据在设备或系统被非法获取，也能保证数据的机密性，不被解读。

4. 访问控制：监理公司会建立适当的访问控制机制，只有经过授权的人员才能访问存储通信数据的设备或系统。这包括定义用户角色和权限，限制访问的IP地址，使用强密码等。

5. 安全审计和监测：监理公司会进行安全审计和监测活动，以检查通信数据的机密性措施是否得以有效实施。监测活动包括对通信流量的实时监控和分析，以及对设备和系统的日志审计等。

6. 持续安全更新：监理公司会定期更新和升级通信工程中的设备和系统，以获取最新的安全补丁和更新。这有助于修复已知的安全漏洞和弥补系统的安全缺陷。

7. 安全意识培训：监理公司会组织和推行安全意识培训，向相关人员提供有关保护通信数据机密性的培训。培训内容包括信息安全的基本知识、保护机密信息的重要性以及应急响应措施等。

通过以上措施，通信工程甲级监理公司能够保护通信数据的机密性，确保敏感信息不会被未经授权的人员访问或泄漏。同时，监理公司也会持续关注和应对新出现的安全威胁，以保证通信数据的安全性。